Diğer süt ürünleri gibi, Çerkes peyniri de kolayca sindirilebilen mineral tuzların (kalsiyum, potasyum, sodyum, fosfor, magnezyum, kükürt, demir, çinko, bakır) kaynağı olup içinde çok sayıda vitamin bulunur. Beta-karoten, retinol, B1, B2, B3, B5, B6, B9, B12 vitaminleri ve D vitamini, E, H, askorbik asit. Ayrıca Çerkes peynirinde birçok amino asit ve enzim bulunur, yağlar, küller, karbonhidratlar, şekerler (mono ve disakkaritler), organik asitler içerir.
Çerkes peynirinin kalorili içeriği 100 g ürün başına 240 kaloridir, bu özellikle peynirin tüm yararlı özelliklerini göz önünde bulundurarak pek fazla değildir. 80 gramda, vücudun ihtiyaç duyduğu amino asitlerin günlük normunu içerir. Ayrıca bu dilim günlük kalsiyum, B vitaminleri ve sodyum ihtiyacının yarısını da kapsayacaktır.
Çerkes peynirinin kullanımı, sinir sisteminin çalışmasında (B vitaminleri ve eser elementleri hayati derecede gerekli olan) sindirim üzerinde yararlı bir etkiye sahiptir (içinde bulunan enzimler bağırsak mikroflorasını iyileştirir).